Una guida o un tutorial non penso che ci sia o si riesca in quanto diciamo che ogni script fa storia a se; detto questo in linea di massima si può dire che la maggior parte delle integrazioni js e fogli di stile avviene nella sezione <head>...</head> del documento html ma non è raro trovare dichiarazioni di script anche nella sezione body; quindi inpostazioni Generali sezione esperto di website Codice personalizzato per la sezione HEAD.
Il richiamo o l'attivazione del codice (se prevista) è di solito associata ad un gestore di eventi posto all'interno di <body>...</body>.
Si deve perciò avere ben chiaro in testa, prima di avventurarsi nel copia/incolla, di quale sia la struttura di un documento HTML.